1969年毕业于北京医学院口腔医学系大学本科；1981年获医学硕士学位，1988年获医学博士学位；1986年7月至1988年1月留学美国印第安纳大学口腔医学院，访问副教授；1993年4月至11月赴澳大利亚悉尼大学和阿德来德(Adelaide)大学高访。1991年破格晋升教授兼主任医师，1993年获第五批博士生导师资格。1991年1月获国家教委和国务院会授予的“做出突出贡献的中国博士学位获得者”，1992年获政府特殊津贴待遇，1998年被评为卫生部有突出贡献的中青年专家。

历任口腔正畸科副主任、常务副主任，院副书记，北京医科大学副书记兼副校长、北京大学副校长；现任北京大学校务委员会副主任、北京大学口腔医学院颅面生长发育研究中心主任。兼任全国医学专业学位指导委员会委员、中华口腔医学会常务委员、口腔正畸专业委员会前任主任委员、口腔正畸学杂志副主编、国际正畸杂志“ORTHO”的编委、美国AJO-DO杂志及Angle Orthod.杂志的审稿人、美国Case大学口腔医学院客座教授，武汉大学口腔医学院名誉教授，华中科技大学口腔医学系名誉系主任及客座教授，南京医科大学客座教授；曾任日本新泻大学口腔医学院客座教授及悉尼大学口腔医学系访问教授等。由林教授研发、具有我国自主知识产权的传动直丝弓矫正技术已被卫生部列为十年百项推广技术之一。

首次提出了颈椎骨骨龄定量分期法。作为第一作者或通讯作者在口腔正畸3种SCI收录的杂志发表论著，取得了我国大陆正畸界历史性零的突破。是我国正畸界培养的第一位博士，1991年成为我国正畸界唯一获得国家教委和国务院学位委员会授予的“做出突出贡献的中国博士学位获得者”，1992年获政府特殊津贴待遇，1998年被评为卫生部有突出贡献的中青年专家。在国内外杂志上发表了100余篇论文，是我国正畸界在SCI收录的杂志上发表论文最多的学者；获省部级科技成果奖15项，国家专利16项，出版著作10余本，其中主编4本。作为负责人承担过国家“863”科技攻关项目、科技部“十五”科技攻关项目及卫生部重点科技项目、国家自然科学基金项目等。共培养出近30名博士。

1991年破格晋升教授兼主任医师，1993年获第五批博士生导师资格。1991年1月获国家教委和国务院会授予的“做出突出贡献的中国博士学位获得者”，1992年获政府特殊津贴待遇，1998年被评为卫生部有突出贡献的中青年专家。

现任主要社会职务：⑴全国医学专业学位指导委员会委员，⑵中华口腔医学会常务委员，⑶中华口腔医学会正畸专业委员会主任委员，⑷日本新泻大学口腔医学院客座教授，⑸华中科技大学兼职教授、口腔医学系名誉主任，⑹南京医科大学兼职教授，⑺中华医学科技奖和中华医学青年奖评审委员会委员，⑻中华医学会医疗事故鉴定委员会专家成员，⑼全国高等医学会行政管理分会副理事长等。

从1994年起，曾协助党委分管过北京医科大学的干部工作达7年。从1996年起，协助校长分管人事工作至今。具有较丰富的人事管理工作经验。曾参与领导过北京医科大学重大人事改革工作，取得了公认的成绩。现正参与领导北京大学重要的教师人事改革工作，有改革精神和新的思路。积极参与领导了全校的“非典”防控工作，发挥了重要作用。

林久祥教授是口腔正畸领域具有权威性的知名资深教授，学术造诣深。是全国口腔正畸专业委员会主任委员。在口腔正畸临床治疗骨性牙颌畸形疑难病例方面取得了突破性的重要成就。先后培养出15位博士，6位硕士。先后在国内外发表论文100余篇，其中，3篇分别在国际上口腔正畸专业仅有的SCI 收录的美国正畸杂志、美国Angle正畸医师杂志及欧洲正畸杂志取得了国内历史性零的突破。出版著作8部。先后获省部级科技成果奖16项。现正主持国家“863”基金、国家自然科学基金、教育部博士点基金、北京市科技重点基金及北京大学“985”重点基金等科研项目。