马继援生于1921年1月18日，1935年8月派任青海省南部边区警备司令部（兼司令马步芳）上校参谋长。

1936年8月入中央军校军训班第五期学习。

1937年1月30日叙任陆军步兵少尉。7月毕业后仍任原职。11月升任第82军（军长马步芳）骑兵第3旅（辖三团）少将旅长。

1939年4月28日调任青海省参议会秘书长。

1940年6月14日当选青海省政府（主席马步芳）委员。

1941年3月调任第82军（兼军长马步芳）少将副军长。

1942年8月兼任第82军骑兵第5军两军军官团第2大队大队长。

1943年3月代理第82军军长。

1944年3月11日实任第82军（辖第100师、暂编第61师、新编骑兵第8师）中将军长。10月带职入陆军大学将官班甲级第一期学习。

1945年1月陆大毕业后仍任原职。2月19日晋任陆军步兵上校（直晋）。10月10日获颁忠勤勋章。

1946年4月第82军整编为第82师（辖整编第100旅、整编骑兵第8旅），改任中将师长。

1947年9月5日获颁四等云麾勋章。

1948年1月1日获颁四等宝鼎勋章。7月10日获颁忠勇勋章。9月整82师改称第82军（辖第100师、第190师、第248师），改任中将军长。

1949年5月升任青海兵团（辖第82军、第129军、新编步兵军、新编骑兵军）中将司令官 兼第82军军长。11月15日因“擅自脱离部队”被撤职赋闲。

1950年撤抵台湾后先后就读于三军联合大学、中央训练团、国防研究院。

1951年3月当选“国民大会”代表。

1969年4月聘任国民党中央委员会党务顾问。

2008年汶川大地震发生后，远在沙特的马继援得知地震灾情后，捐献5000美金，以表达对灾区人民的问候。

2012年2月27日病逝于沙特阿拉伯，终年91岁。

1933年，马继援12岁时，由南京中央军政部委任为青海省南北边区警备司令部上校参谋长。1934年任第100师手枪团第1连连副，翌年升为连长。1936年历任第100师部参谋，青海南部边区警备司令参谋长，骑兵第5军及82军军官训练团第3大队大队长，国民革命军陆军上校军衔。1937年任陆军第82军骑兵第3旅旅长，同年4月28日任青海省参议会秘书长。

1940年6月14日任青海省政府委员，此时马继援年仅19岁。1941年升任第82军少将副军长，同年兼任中国国民党青海省党部委员及三民主义青年团青海支团部干事长。1942年任国民党西北精锐陆军第82军军长，国民革命军少将军衔。1943年82军、骑兵第5军合编为第40集团军后，任陆军第82军军长。在山西运城，河南淮阳，皖北的寿县、风台等地重创日军，令日军闻风丧胆。后参加围剿新四军的战斗，将新四军打出安徽，是役新四军彭雪枫部吃了骑兵的大亏损失5000人以上。后中央入陆军大学将官班甲级第一期学习。在学习期间，经蒋介石夫人宋美龄介绍，结识了宋美龄的干女儿四川才女张训芳。后在宋美龄的撮合下，与张训芳结婚。

1945年8月抗战胜利后，国民革命军第40集团军番号撤销，第82军整编为整82师，任师长。在国共大战中，其主要的军事战役成绩虽然给当时的国民党政府注入了兴奋剂，但却无法挽回腐败的蒋介石统治集团的灭亡，最终在兰州战役失败后，彻底赔光了马氏家族三代在甘、青经营的所有资本，落得个逃亡台湾的下场。1947年6月在合水其整编82师重创解放军西北野战军的主力纵队第2纵队，取得所谓“合水大捷”。该役成功击退解放军西野3个纵队的进攻，让西野认识到了青马的战力和骑兵的战术不可小视。8月在宁县子午岭山区腹地的九岘一带几乎全歼解放军西野第4纵队，取得所谓“子午岭大捷”。1948年4月整编第82师重创解放军西野第6纵队教导旅，取得“西府战役大捷”（国军方面称为泾渭河谷之战）。该役以大约不足1500人伤亡的代价，除了杀伤了更多的解放军外，还俘获了2000人的解放军士兵、后勤人员及支前民工。彭德怀元帅自言“西府战役”是其一生“第三次大的败仗”。1949年5月整第82师恢复为陆军第82军，任军长，授国民革命军中将军衔。7月27日升任西北军政公署副长官，国民党兰州战役总指挥，此时年仅28岁。兰州战役国共双方直接参战的总兵力达30万人，解放军第一野战军第2兵团、第19兵团5个军近15万人参战，此战役在解放军第一野战军强大军事打击下，国民党西北军的5万步兵精锐几乎损失殆尽，骑兵第5军逃脱后进入新疆，最后起义。兰州战役最终以青马失败告终，从此也结束了青马在西北长达近一个世纪的统治。同年9月随国民党军败逃台湾，从此结束了他的军事生涯。

马继援很年轻的时候就当上了中将军长，马步芳只有一个儿子，对其相当器重，从小栽培有加。马继援曾在重庆见识一位汉族女子，名叫张训芳，是南京才女。马继援旋即坠入爱河，但是，其母决不同意。汉回通婚，这是有违族规的事情，问题很严重。然而，马步芳爱子情切，居然同意了这门婚事。不过，他有条件，一是要灌肠，因为马家是伊斯兰教徒；二是要改名，因为马步芳名字中有个芳字。为此，女方家长亦反对。马继援居然为此长跪岳母面前达10小时，可见其痴情的程度。最终，亲事才圆，张训芳改名张训芬。