民国22年执教于国立上海医学院。为配合教学，收集和制备数百件解剖标本，建立当时国内有名的解剖标本陈列室。翌年，国外学者以少数中国人和混血儿的脑为依据，著文断言中国人脑更接近于类人猿，恣意贬低中华民族，齐氏与张鋆教授合作撰文《中国人脑的沟型》发表于美国《体质人类学杂志》予以驳斥。抗日战争初期，齐氏筹建贵阳医学院，任解剖学科主任。后在昆明、重庆任教。解放后，任上海第一医学院教授、人体解剖学教研室主任。

齐氏治学严谨，诲人不倦。虽身患重病，还坚持讲课、指导实验，遇有问题，要求师生到他病榻前进行讨论，被青年师生视为严师益友。曾带领教师自编中文教材，有《局部解剖学》、《系统解剖学》，内、外、妇、儿、皮肤、耳鼻喉各专科解剖学教材10余种，扭转解剖学沿用外文教材的局面。另编绘《人体解剖学图谱》四卷，所设计描绘的各类标本图画，被不少解剖学教材用为插图。晚年致力于心血管的研究，发表有冠状心血管、肾内血管和肝内血管等论文10余篇。

齐氏为中国解剖学会发起人之一，民国36年在上海筹建解剖学会，任总常务理事。解放后任中国解剖学会理事、上海解剖学会副理事长、《解剖学通报》主编、《辞海》人体解剖学编委，还被聘为卫生部医学科学委员会人体解剖学及神经解剖学专题委员会委员。