1991年应聘到澳门大学任教，先后出任科技学院院长、澳门大学副校长、校长。

1998年5月起任全国人大澳门特别行政区筹委会委员。周礼杲长期从事信号处理、模式识别和电脑在医学上的应用领域的研究工作，所领导的胎儿监护科研组在胎儿心电等信号处理方面被认为具有国际先进水平，并在1995年获中国国家教委科技进步二等奖。

由于出色的学术研究工作，周礼杲连续多次担任IEEE/EMBS世界大会的国际委员会委员，为国际无线电科学联盟委员、美国纽约科技学院院士、美国电机与电子工程学会高级会员。中国US-RIK组委员会主席、《电子学报》编委等。

1999年获日本创价大学荣誉博士学位。2000年─2002年12月31日当了澳门科技大学的校长。

为了迎接澳门回归中国，他将原设在社会及人文科学院内的中文系独立出来，成为中文学院，并在法学院开设了中文法律课程，并在澳大筹办幼稚园、小学和中学，成为一条龙学校。还组织两届两年制葡语课程，为外交部培养了28名葡语外交人才，受到外交部赞扬。还与国内外140所知名大学签订合作协议。1998年被选为联合国大学国际软件研究所董事会主席。1999年接受日本创价大学荣誉博士学位，因年龄关系，改任澳大校长室高级顾问。澳门总督授予“澳门政府专业功绩勋章”。旋被特区政府聘为澳门科技大学校长。1998年任澳门特别行政区筹备委员会委员，到处为回归奔走呼号。