穆贾迪迪1926年出生于一个声望极高的阿富汗家庭，信奉伊斯兰教，全家都是逊尼派的普什图人。有人说，穆贾迪迪家族身世显贵，曾经是印度的贵族，20世纪初整个家族才迁至阿富汗，因此家族还有部分昂格鲁-萨克逊血统。但是，这一点从未得到穆贾迪迪家族的承认。 在穆贾迪迪二三十岁的时候，经常参加一些反苏组织，并和族人策划一些行动。1959年至1964年，他被当时的亲苏政府关入大牢，罪名是密谋刺杀当时的苏联部长会议主席尼基塔·赫鲁晓夫（Nikita Khrushchev）。

出狱后不久，穆贾迪迪又多次参与反苏示威游行。20世纪70年代，他再次遭到政府通缉，被迫逃到丹麦，担任哥本哈根大清真寺的主持。1978年，阿富汗民族解放阵线成立，穆贾迪迪出任该党的主要领导人。

1979年苏联军队大举进攻阿富汗，穆贾迪迪家族成为他们的一个主要打击对象。短短几年时间，穆贾迪迪家共有180人被苏军杀害，穆贾迪迪发誓要报不共戴天之仇，坚持抗苏到底。从此，他凭借着自己家族的财产和声望在普什图族人中招兵买马，成立了一支反苏游击队。

他的反苏游击战一直坚持到苏军1989年彻底撤出阿富汗，而他的事迹也在阿富汗广为流传。1992年，苏联支持的阿富汗傀儡政权垮台后，穆贾迪迪出任 阿富汗总统。他为人温和，被称为“和平总统”，但是他就任总统的时间只有2个月。很快，1992年12月30日， 布尔汉努丁·拉巴尼在大选中获胜，接替他担任总统直至1994年底。

穆贾迪迪喜欢缠着白色头巾，戴着白边眼镜，留着白色的长胡子。他虽然只当过2个月的总统，但德高望重，在阿富汗人气很旺。相比他的竞争者拉巴尼，穆贾迪迪优势明显。他是在阿富汗占人口多数的普什图族人，仅凭此就能帮他拉到不少选票。而拉巴尼不仅不属于普什图族人，还认为妇女应当保守，戴上面纱。 如今，穆贾迪迪住在距中国使馆不远的地方，保卫严密。现任临时政府总理卡尔扎伊、外交部长阿卜杜拉、国防部长法西姆和各省省长，都经常登门与穆贾迪迪商讨国家大事。卡尔扎伊曾在穆贾迪迪身边工作过十多年，现在每当遇到重大国际、国内问题的时候，都来到这里，同他一起讨论。

穆贾迪迪现在虽然不担当任何职务，但是日常工作繁忙，主要是接受记者采访、接待一些国家的使节。负责他每天活动安排的人名叫阿赫迈德·波帕尔，是卡尔扎伊的表弟。

但对于众多记者关于“是否希望再当总统”的提问，穆贾迪迪却很谨慎，他只是回答：“谁当总统取决于人民，由人民来选择。如果人民选举我，我会接受选举结果的。”

新华网喀布尔2005年12月20日电 阿富汗前总统西卜加图拉·穆贾迪迪20日在阿富汗新议会上院选举中赢得上院议长一职，议会下院议长的选举因议员们无法就选举程序达成一致而搁置。

30多年来首次通过选举产生的阿富汗新议会20日正式召开第一次会议。102名议会上院议员就上院议长人选进行了投票。第一轮投票中，穆贾迪迪以50票领先，另外2名候选人得票数分别为27票和25票。位列第3名的候选人随即宣布支持穆贾迪迪，穆贾迪迪顺利当选。

70岁的穆贾迪迪曾创立阿富汗民族解放阵线。1992年，纳吉布拉政权垮台后，他曾担任过为期2个月的临时总统。2001年阿富汗战争后，他出任阿富汗大国民会议（大支尔格会议）主席。

2019年2月11日，据知情人士证实阿富汗前总统穆贾德迪已经去世。