1998年当选议会议员。2001年秋季当选为基督教民主党领袖，带领该党走出困境。2002年5月他领导该党在议会大选中获胜，成为执政党。2002年7月，他正式就任首相，组成新内阁，成为8年以来第一位基督教民主党首相。同年10月16日，他在议会宣布，由于两名大臣当天辞职造成三党联合政府不能正常运作，他已向女王贝娅特丽克丝递交内阁集体辞呈。同年10月21日就任看守内阁首相。在2003年1月举行的荷兰议会选举中，他领导的基督教民主联盟以微弱的优势战胜了工党。2003年5月在新一届联合政府中继续担任首相。

　　巴尔克嫩德的妻子是大学法律教授，也是基督教民主党成员。他们有一个女儿。

　　２００４年４月，巴尔克嫩德作为欧盟候任轮值主席对中国进行了工作访问。２００８年８月来北京参加第２９届奥运会开幕式及相关活动。２００８年１０月对中国进行正式访问并出席在北京举行的第七届亚欧首脑会议。