1875～1881年他参加了德国考古学家恩斯特·库尔提乌斯主持的奥林匹亚遗址的发掘。1882～1890年参加了德国考古学家海因里希·谢里曼在特洛伊城址的发掘。1884和1885年，他与谢里曼在梯林斯，挖出了公元前第2千年迈锡尼文明的宫殿和防御工事。从1887～1911年，他任驻雅典的德国考古研究所秘书。1890年谢里曼逝世后，德普费尔德主持了特洛伊的考古发掘工作。1923年任耶拿大学教授。

德普费尔德最大的成就，是对特洛伊考古走上科学轨道作出了重要贡献。他曾与谢里曼一起，将特洛伊遗址划分出 9个连续的文化层。在他主持工作时，又集中发掘该遗址的边缘地区，发现了青铜时代中期和后期的废墟。他认为被希腊人毁灭的、皮里阿姆王时期的特洛伊城是在第6层，因而详细地绘制了第6层的建筑平面图，并且在《特洛伊与伊利昂》(1902)一书中确定了特洛伊遗址各文化层的年代。德普费尔德还著有《古代伊萨卡》(1927)，提出现代的莱夫卡斯岛即《奥德赛》中的伊萨卡。还著有《古雅典及其市场》(1937～1939)等书。在谢里曼所著的《梯林斯》一书中，他写了第五、第六两章(建筑和1885年的发掘)，占全书篇幅一半左右，详细地叙述了梯林斯遗址建筑的特点。