马曰琯本籍安徽祁门，祖父马承运始业盐两淮，马曰琯自小侨居扬州新城东关街，世代经营盐业。马曰琯曾经以附贡生的资历援例候选主事，授道台衔。雍正十二年（1734年），独资兴建梅花书院，此院原名为崇雅书院。乾隆元年（1736）马曰琯曾被推举参加博学鸿词特别考试，坚辞不赴。马曰琯有弟马曰璐（1711～1799），字佩兮，号南斋，兄弟互为师友，人称“扬州二马”。

　　马曰琯家庭豪富，但为人慷慨，热心地方公益事业，曾捐资开掘扬州沟渠，筑渔亭孔道等。乾隆帝南巡时，赐御书。杭世骏在写马曰琯墓志铭称：“以济人利物为本怀，以设诚致行为实务。”“倾接文儒喜交久敬，意所未达，辄逆探以适其欲。”

　　马曰琯一生喜爱写诗、藏书和结交文人雅士，雍正年间，在扬州建造小玲珑山馆，广交天下名流，“四方人士闻名造庐，授餐经年，无倦色”。著名学者全祖望、厉鹗、金农、郑板桥、陈章等都是小玲珑山馆的常客。马曰琯曾自为盟主，同厉鹗等人结“邗江吟社”，吟诗作赋、游历山水。马曰琯还替郑板桥还清债务，袁枚说马曰琯“横陈图史常千架，供养文人过一生”。沈德潜评其诗为“峭刻得山之峻，明净得水之澄”，可见水平很不一般，今传《沙河逸老集》10卷和《嶰谷词》1卷。《清史稿·文苑传》有马曰琯传，足证他的文名确为当时所重。

　　马曰琯喜爱考校典籍，家中专设刻印坊，不惜费资刻印书籍，如刻朱彝尊《经义考》一书，就花去千金，当时称这一批书为“马版”。小玲珑山馆又是马氏藏书楼名称，藏书多达10余万卷，有“甲大江南被”之说。1772年四库全书馆设立，马曰琯的儿子振伯献藏书776种，为全国私人献书之冠，受乾隆皇帝褒奖，赐《古今图书集成》一部、《平定伊犁金川诗图》1幅，并亲题《鹖冠子》相赠。《四库全书总目》著录马氏藏书有373种5529卷，其中经部57种670卷，史部123种1658卷，子部43种731卷，集部150种2470卷。乾隆四十二年（1777），马曰琯的儿子马振伯呈请将梅花书院归公，改由盐务衙门管理。

　　【霍家桥道中和竹町韵】

　　车鸣十五里，南郭且闲寻。冷翠风前乱，古香云外侵。

　　人因吟秀句，天为写寒林。更待来朝雪，平田一尺深。

　　【题方邴鹤琴鹤送秋图】

　　一声鹤泪泬寥天，坐对高空思渺然。试向孤亭弹别调，白云黄叶满山前。

　　【挽许卯君】

　　十上知稀一哭回，文穷翻令此身摧。空余秋卷搜行箧，那复春卿解拾才。

　　沦没已无仙桂分，凄凉赢得酒垆哀。不辞雪涕为君语，及第由来慰夜台。

　　【追凉示四弟半查】

　　追凉到处与兄连，竹榻生衣尚宛然。覆局每当疏雨后，论书多在晚风前。

　　丹铅手勘留三传，茶荈孤倾已十年。今日夜台应太息，谢家群从总华颠。

　　【拟复竹西亭和洴江太史】

　　邗沟东畔竹西亭，岁岁寻游感废兴。细雨斜廊还有井，夕阳秋寺欲无僧。

　　几时碧玉围千个。依旧红栏覆雨层。收取江南烟树色，苍茫祇借一枝藤。