人物经历
1938年毕业于国立上海医学院。
1940年任中国红十字会第一医院医师。
1943年来广西省立医学院工作，历任讲师、主治医师、附院主任、副教授等职。
1947年公费派送美国哈佛大学医学院内科进修班学习，1949年回国。研修期间在善后救济总署广西分署难民医院、中国人民解放军49医院任内科主任，1949年回国。
1950年复来广西省医学院任内科教授。先后担任院务委员会副主任委员，副院长，院革命委员会副主任，院长，党委副书记，咨询委员会主任，广西肿瘤研究所名誉所长等职。并曾当选为中共十大代表，广西壮族自治区第四次党代表大会代表，自治区党委委员，广西壮族自治区第五、六届人大代表、人大常委会副主任。自治区第一、二、三届政协委员。1956年加入中国共产党。先后赴东德、波兰、捷克、苏联及越南访问，并多次参加意大利、美国、日本等国召开的国际学术会议。
1979年获全国劳动模范的称号。并担任广西壮族自治区科协主席及名誉主席。获得国家教委颁发的“从事高校科技工作四十年，成绩显著，予以表彰”的荣誉证书。
1990年12月退休。
主要成就
长期从事肝癌研究，发现中国第一个肝癌高发区。
20世纪60年代，肿瘤学专家叶馥荪教授在广西扶绥县建立起中国第一个肝癌高发现场防治点，对肝癌进行了一系列研究，首先论证了肝癌病因的三大危险因素中的两大因素，为学校的肿瘤学科发展成为全国重点（培育）学科奠定了坚实的基础。
主要论文
《广西某县原发性肝癌的发病率及流行因素初步探讨》（《天津医学杂志》，1965年第5期）
《广西肝癌建国以来防治研究进展》（《广西医学杂志》，1984年第5期）
叶馥荪、莫志纯等教授在美国《cancerresearch》杂志发表的论文《乙型肝炎病毒感染和黄曲霉毒素与肝癌关系的队列研究”》，至今被引用204次，在全国名列前茅。
主要著作
《广西肝细胞癌的流行病学及发病学研究》（1984年日本《肝脏》第2卷，7号）
《中国原发性肝癌流行病学与早期诊断的研究》（1986年美国《癌症研究的进展》47卷297—327页）
科研成果
1954年广西医学院从桂林迁来南宁，叶馥荪等医务人员注意到本地区肝癌患者较多，遂下定决心要探索攻克肝癌的办法。1961年，他组织和率领肝病调查队，深入到广西肝癌病人最多的扶绥县、贵县等地进行调查研究。1964年明确了扶绥县肝癌、肝硬化发病率特别高，是中国肝癌高发区，也是世界上肝癌高发区之一。调查中首先注意到广西肝癌与玉米为主要口粮有关，肝病高发和饮水污染也有一定的联系。他又注意到国外学者关于霉变粮食能引起动物肝病和肝癌的报道。他和助手们下乡进行粮食发霉情况的检测，用发霉粮食作大鼠诱癌试验。12个月诱发了肝癌。初步揭示了黄曲霉素可能是肝癌高发区主要致癌的原因。由于“文化大革命”的冲击，研究工作暂停。他恢复工作后，又组织调查小组到扶绥县及周围县的乡镇检查肝癌、肝病的发病，粮食污染黄曲霉素的情况，查地理、气候、水源。通过对数万人次的调查，千万份粮食和血标本的检测，大量数据处理分析，明确了肝癌高发与口粮污染黄曲霉毒素程度、肝病背景和饮用不洁塘水密切相关。进一步论证了肝癌的三大危险因素：黄曲霉毒素、乙型肝炎感染和饮用水污染。
1969年，全国肿瘤会议期间，《天津医学杂志》发表了叶馥荪等撰写的《广西某县原发性肝癌的发病率及流行因素初步探讨》论文，并展出了广西实验动物诱癌成功的图片。1978年获全国科学大会科研成果奖。1973年，他在意大利，1981年至1984年在日本、美国召开的国际肿瘤会议上宣读《广西肝细胞癌的流行病学及发病学研究》《中国原发性肝癌的流行病学及早期诊断的研究》等论文，深受国外学者、专家注意，并在《肝脏》（日）《癌症研究的进展》（美）等杂志上发表。1982年，美国洛杉矶南加州大学医学院亨德森教授主动与叶馥荪联系，并签订了《肝癌与鼻咽癌流行病学研究》的协议，由美方提供13万美元的研究经费，双方进行合作研究。
1981年他承担的“六五”国家攻关项目，“肝癌预防措施——黄曲霉毒素在肝癌病因的作用及阻断研究”，1987年获广西壮族自治区科技进步二等奖。
叶馥荪对肝癌的预防及有关治疗、预防肝癌的组织建设和人体培养也很重视。广西壮族自治区政府采纳他的意见，成立了扶绥县肝癌防治研究所。并通过传、帮、带及举办各级学习班，培养了一批肝癌科研骨干及大批基层调研及防治队伍。院内的肿瘤研究小组，也发展到约有400人编制的广西肿瘤防治研究所。
社会兼职
中华医学会全国理事会理事（1980—1985年）
中华内科学会全国委员会委员（1982—1986年）
中国科协会全国委员会委员（1982—1986年）
自治区科协会主席、名誉主席（1982—1986年）
中国抗癌协会副理事长、名誉副理事长（1984—1988年）。
主要荣誉
中共十大代表；
广西壮族自治区第五、六届人大常委会副主任；
1978年获全国科学大会先进工作者称号；
1979年获全国劳动模范称号；
黄曲霉毒素、乙型肝病感染等因素对肝癌相互作用的流行病学（参加），1987年获“六五”全国攻关课题自治区科委二等奖。