曹锦辉毕业于花莲县立光复国中，国中毕业以後，与大部份台湾东部的球 员一样，被挖角到西部球队，投入高雄县高苑工商，成为王牌投手。并在88学年度高中棒球联赛，与南英商工王牌投手郭泓志同场竞飚球速，郭泓志投出最高球速时速149公里的纪录，而曹锦辉则投出时速152公里，刷新台湾高中棒球最快球速纪录。

　　1999年高中毕业後，曹锦辉短暂加入职棒台湾大联盟的年代雷公队，出赛三场无关胜败和救援记录，防御率2.45。，同年，曹锦辉以220万美元签约金加入科罗拉多洛矶队，在美国职棒小联盟磨练四年，其间并曾因肩伤开刀治疗。

　　曹锦辉于2003年7月26日在 美国职棒大联盟首度担任先发投手，成为继野手陈金锋后 ，第二位登上大联盟的台湾球员，却是以投手身份，第一位登上大联盟的台湾球员。在科罗拉多落矶队的主场丹佛库尔斯球场面对密尔瓦基酿酒人队时，曹锦辉主投六又三分之一局，取得大联盟生涯首胜。除了许多投手记录的第一次之外，其後也在该年挥出台湾选手在美国职棒大联盟的首支安打记录。2003年球季共获得三胜三败的成绩。

　　2004年球季，曹锦辉因手伤减少了出赛机会，仅有零星的后援记录，并一度到小联盟的3A(AAA)球队作调整。直到下一个球季，开始被球队教练定位为主力後援投手再度出发。

　　2004年，代表台湾出赛雅典奥运。成功对澳大利亚代表队守护下一胜得到救援点，可惜对日本代表队一战平手时上场救援失利，而中华队也失入进入决赛的机会。曹锦辉除了在美国职棒大联盟中为台湾争光之外，亦曾多次代表台湾在国际棒球赛中出赛，包含1999年的IBA世界青棒赛、1999年的亚洲棒球锦标赛等。

　　2005年球季，曹锦辉在科罗拉多落矶队担任主力救援投手，后因手伤开刀复健，本季确定无法再出赛。

　　2006年球季，确定要到下半季才能复出。