1935年起历任第一师第三团中校团附，代理团长，西北游击干部训练班第二期学员总队总队长

1937年任国民党第1军第1师第1团上校团长时，参加“八·一三”上海抗日斗争。

1944年任第九十军二十八师少将师长。

1945年任国民党军队28师少将师长时，曾指挥本师参加豫西西峡口战役，在友军的协同下，连续四个月艰苦战斗，歼灭日军139联队，该师亦伤亡官兵400余人，王被调任为27军中将军长。

1949年12月，带领学生总队，跟随李文第五兵团行动，在该兵团处于困境时极力劝说李文同人民解放军接洽，宣布起义，受到人民解放军第2野战军刘邓首长欢迎。后入西南军政大学高级军官研究班学习，曾任高参，教官，民革四川省委会副主任委员，第六届全国政协委员，四川省政协常委。著有《胡宗南部“追剿”红军概况》，《胡宗南集团1946年发动晋南战役纪要》，《李文第五兵团在川西投降纪略》，《整编第二十九军瓦子街战役就歼记》，《血溅杨行，刘行记》等。

1985年6月2日，四川省人民政府为其颁发了起义证。

王应尊曾被中华人民共和国国防部授予四等云麾勋章、抗战胜利勋章各一枚以及其他各种奖章5枚。后任解放军西南军区高参，民革四川省委副主委，四川省政协常委，全国政协委员，民革中央委员。