源之助是农民家的三男，从小便面无表情，亦不会哭笑，家人厌恶他，连吃也不让他吃好。之后一名武士子女欺辱他，不仅虐打，而且用马粪填了他一嘴。源之助将该名武士子女砸向墙而死，父母畏惧，将他吊起不管，后被虎眼流掌门虎眼救下，收为义子。

成为虎眼流门徒的源之助对虎眼衷心不二，每日刻苦练习，同时，亦在师兄教导下学习写字与文化，藤木不是天才型，而是后天努力型，他的才能是有的，但没有清玄那么卓越，但依靠后天刻苦不懈的发奋，终于最后打败了宿敌清玄。

拥有一流武士的实力。

虎眼是从冷漠父母手中救自己一命的恩人，亦是教习自己剑术的恩师，同时也是给了自己武士身份的再造之人，源之助对虎眼的感情，超过任何人，甚至远高于自己性命和个人追求。源之助唯一一次失态痛哭，就是在虎眼死后。

对于源之助来说，虎眼是父亲，是师傅，是恩人，对于虎眼的任何要求命令，源之助都会不假思索的服从，即使那条命令会要了自己的命。当虎眼要求三重与清玄当众洞房时，爱恋三重的源之助即使内心激烈的口鼻流血，亦默默的服从了师傅，按住了三重的一只手。源之助这种绝对服从的性格，被三重定义为傀儡。

伊良子清玄，前来虎眼踢馆的美艳剑客，是的孩子，对自己的出生非常忌讳。后被虎眼师范牛股打败后，一心想加入虎眼。成为虎眼弟子后，展现了强大的天赋，而成为源之助的竞争对手。虎眼没有儿子，只有一女，因此，欲在门徒中挑选一名精英，作为入赘女婿，同时继承虎眼流。在清玄来之前，源之助是公认的继承人候选，而清玄来后，打破了此局面。最后，虎眼选中了清玄作为继承人，而源之助对于此，默默的忍受并服从了。

就在清玄和虎眼的女儿三重订婚没多久，他和虎眼的小妾阿郁的奸情被发现了，清玄被逐出门派，并被刺瞎双眼。受了非人折磨的清玄发誓报仇，他依靠自身剑术投靠到了检校门下，利用虎眼门徒的出卖，先后除掉了虎眼几名重要弟子，最后杀死了虎眼本人。

清玄被驱逐后，源之助成为继承人，他与三重申请复仇，在复仇战中，源之助死死克制住清玄，本有两次机会杀死对方，但一次因为清玄跳至诸多显赫面前而丧失机会，另一次因清玄在衣服内缝了铠甲而幸免于难。错失两次机会的源之助，被清玄砍下左臂，虚脱晕厥。

之后，由上面下令，源之助和清玄进行第二次对决，两人一人失明跛脚，一名断臂，再次展开宿命之战！

三重是虎眼的独生女儿，二人自小便认识，可谓一起长大的青梅竹马。源之助对三重既憧憬又爱慕，但一直隐忍于心，没有表露。唯一的一次表白，是将从海边带回的白色贝壳，悄悄放在三重的枕边，暗示自己守护三重的决心。

三重对源之助，原本是有好感的。因为“缔结男女婚嫁之约”那晚，藤木没有站出来保护自己，而是顺从虎眼甚至帮其按住三重一只手，而对源之助死心。之后，在三重出逃时，将手中剑故意抛出，源之助竟要剑不要人，拼命接住宝剑，而不去扶摇摇欲坠的三重，至此源之助在三重心中彻底没有希望。

剑豪生死斗得特征是，没有绝对化得脸谱，每个人都很真实，善恶交织，谁都有可取之面，亦有缺憾之面。源之助正直、隐忍、果断、刻苦，但对师傅和武士道过度顺从，心有不平也不申诉，事有不公亦不反抗，这种人，要是跟了正直大气的主人尚可，要是跟了卑鄙残忍的主人，则极为危险。另外，藤木生性耿直，有仇必报，不懂掩饰和周旋，作为一派掌门或一家之主的话，在危机重重的社会上，往往很难保护家族。