1995年，朱妍自北京舞蹈学院毕业后，进入中央芭蕾舞团开始艺术生涯。作为中芭首席主演，在多部中外舞剧中担任女主角。

二十余年间，朱妍曾多次作为客席艺术家，与众多国内外知名芭蕾舞团合作，应邀担任舞剧主演。1999年赴瑞典皇家芭蕾舞团主演《仙女》，2002年赴新西兰皇家芭蕾舞主演《天鹅湖》，2005年赴丹麦皇家芭蕾舞团主演《仙女》，2006年应香港芭蕾舞学会邀请在香港主演《吉赛尔》等。此外还多次应邀参加国际艺术节和庆典晚会，1998年参加巴黎国际芭蕾舞比赛颁奖晚会，2000年和2006年参加美国维利国际舞蹈节，2001年参加上海国际芭蕾舞比赛颁奖晚会，2005年参加丹麦皇家芭蕾舞团“纪念布侬维尔诞辰两百周年”庆典晚会，2010年赴匈牙利、斯洛伐克参加明星汇演，2007年参加日内瓦联合国艺术节，2010年和2011年连续两次参加汉堡芭蕾舞团“尼金斯基芭蕾盛典晚会”（NijinskyGala），2012年参加澳大利亚芭蕾舞团50周年庆典晚会。

2016年11月2-3日，朱妍与台湾舞蹈家、编舞家许芳宜合作，在国家大剧院演出了舞蹈作品《我心》。

2018年5月18日，参演的电影《擒贼先擒王》上映。

包括古典芭蕾舞剧《天鹅湖》《堂·吉诃德》《吉赛尔》《海盗》《睡美人》《仙女》《胡桃夹子》《泪泉》《希尔薇娅》《舞姬》（第二幕）《巴赫塔》（第三幕）等，中国芭蕾舞剧《红色娘子军》《大红灯笼高高挂》《牡丹亭》《过年》《梁祝》，戏剧芭蕾《罗密欧与朱丽叶》（约翰·克兰科）《奥涅金》《小美人鱼》（约翰·诺伊梅尔），以及罗兰·佩蒂的《卡门》《蝙蝠》《年轻人与死亡》和《平克·弗洛伊德芭蕾》，威廉·福塞的《多少悬在半空中》，乌韦·舒尔茨的《贝多芬第七交响曲》《拉赫马尼诺夫第三钢琴协奏曲》，乔治·巴兰钦的《小夜曲》《谁在乎》《辉煌的快板》《主题与变奏》《四种气质》等，此外还有《春之祭》《最后四首歌》（本·史蒂文森）《五首诗》《时代舞者》《高山流水》《Creature》（帕特里克·德·巴纳）《超越黑暗》《波莱罗》《哈姆莱特》（费波）等现代芭蕾作品。

2015年出版图文集《芭蕾让我遇见你》。

朱妍曾多次获得国内外芭蕾比赛大奖和表演艺术重要奖项。1998年获第十八届保加利亚瓦尔纳国际芭蕾舞比赛成年组女子金奖，同时获得“总统夫人表演艺术特别奖”；2011年在被誉为“舞蹈奥斯卡”的第十九届俄罗斯贝努瓦国际芭蕾艺术节（Benoisde la Danse）中获选“最佳女舞者”；1993年获第一届名古屋国际芭蕾舞比赛特别奖；1994年获第四届桃李杯舞蹈比赛银奖；1994年获第六届巴黎国际芭蕾舞比赛“巴黎歌剧院”协会奖；1999年凭借《仙女》，获得文化部中直院团国庆五十周年评比展演“优秀表演奖”；2010至2013年连续四届获得国家艺术院团演出季“优秀表演奖”（2010年《奥涅金》、2011年《卡门》、2012年《小美人鱼》、2013年《堂·吉诃德》）；2008年和2010年荣获第一、三届“华鼎奖”年度舞蹈最佳表现女演员奖；2010年荣获中国文化艺术政府奖——“文华表演奖”；2015年凭借在芭蕾舞剧《小美人鱼》中的出色表现，获得第二十五届上海白玉兰戏剧表演艺术奖“主角奖”。

曾先后获选“中央国家机关十大杰出青年”（2008）、“全国文化系统先进工作者”（2014）、第三批国家“万人计划”青年拔尖人才（2016）、文化名家暨“四个一批”人才（2017），文化部舞蹈专业高级职称评审委员会委员（2012、2014、2017）、文化部“杰出青年”（2004）、“文化部青年岗位能手”（2005）、北京市妇女代表大会代表（2014）。

2015年12月，为纪念朱妍在中芭从艺二十周年，中央芭蕾舞团在北京天桥剧场举办了朱妍专场演出，并为其颁发“杰出贡献奖”，以表彰其二十年间为剧团及中国芭蕾事业做出的努力和贡献。